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2024-01-19

重磅宣布 | Xenium单细胞区分率赋能肿瘤空间组学研究

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Xenium单细胞区分率

赋能肿瘤空间组学研究

鼎点娱乐(以下简称“鼎点娱乐医学”)承继科研立异和勇于争先的精神,与10x Genomics公司合作建设了高水平树模实验室,设置了先进的科研装备,为临床科研提供单细胞转录组测序、空间转录组测序(Visium平台)和基于原位杂交手艺的空间转录组(Xenium平台)检测服务。

2024年1月16日,Xenium手艺平台第一批实验样本检测数据正式下机,质控完全及格,在上海率先高质量高效率完成交付检测和数据剖析。该项目基于研究者对“肿瘤-分子病理-单细胞/亚细胞区分率空间组学”层层递进的研究构想,确定种种类型细胞的空间定位、比例和漫衍特征,逐步将target bio-marker定位在单细胞,为佐证研究者的idea提供了高水准、信息化和可视化的效果与证据。

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图1:肿瘤病理标注

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图2:Xenium数据概览

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图3:Xenium将光学特征解码为转录本表达,收罗并形成图像


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图4-1:使用DAPI对细胞核染色,团结深度学习要领推断完整的细胞界线

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图4-2:使用DAPI对细胞核染色,团结深度学习要领推断完整的细胞界线


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图5:将转录天职配给细胞


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图6-1:实现单细胞/亚细胞区分率的空间转录组剖析,绿点-EPCAM , 蓝点-KLRD1 ,粉红点-LILRB2


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图6-2:实现单细胞/亚细胞区分率的空间转录组剖析,绿点-EPCAM转录本


Xenium 具备简朴快速的事情流程

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鼎点娱乐医学单细胞转录组测序

与空间组学手艺平台


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现在,鼎点娱乐医学单细胞转录组测序与空间组学三大平台已承接多个三级医院临床与科研专家的项目,服务涉及北京、上海、广东和江西等多个区域。鼎点娱乐医学将一连团结肿瘤专家、分子病理专家、生信专家/团队和厂商专家,凝心聚力为客户提供高质量、高效率和可信任的科研服务。


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